על-פי ההסכם הקיבוצי, צוברים הרופאים לצד הזכויות בקרן הפנסיה, גם זכויות בקופות גמל לתגמולים ("קופות גמל"). לקופות הגמל מופרשים תשלומים על-ידי העובד והמעסיק מיתרת השכר שאינו מועבר לקרן פנסיה, אך לא כולל החזר הוצאות כגון: דמי נסיעה וקצובת טלפון.
שיעור דמי הגמולים הכולל לקופות הגמל מיתרת השכר שאינו מועבר לפנסיה הוא כדלקמן: סה"כ דמי גמולים זה (7% + 7.5%) נחלק, על פי רב ומשיקולי מס הכנסה ל-3 קופות גמל:
א. 5% עובד + 5% מעביד לקופת גמל לתגמולים.
ב. 2.5% (עובד + מעביד) לקופת גמל לעצמאיים.
ג. 5% עובד + 5% מעביד לביטוח מנהלים.
עד שנת 2008 קופת גמל לתגמולים היתה שם לתוכנית חיסכון הונית לטווח ארוך או בינוני, שנועדה לצבירת כספים שניתן יהיה למשוך בזמן עתידי כתשלום חד פעמי בגיל פרישה.
בעקבות שינויי החקיקה –