150. הוועידה קובעת, כי המועצה המדעית היא הסמכות המקצועית הבלעדית לקביעת מסלול הכשרת הרופאים, איכות ההתמחות, בחינת כשירותם של הרופאים וקביעת התנאים הנדרשים לקבלת מומחיות, ועל-ידי כל אלה היא שומרת על רמת מקצוע הרפואה בישראל.
151. הוועידה מברכת על שיתוף הפעולה בין המועצה המדעית ובין משרד הבריאות, אף מעבר להיותה גוף סטטוטורי מייעץ למשרד הבריאות.
152. הר"י מגנה כל ניסיון לכרסם בסמכויות שהוענקו למועצה המדעית בחוק.
153. הוועידה קוראת למועצה המדעית ולוועד המרכזי להמשיך ולהוביל את יישום ההתעדכנות השוטפת של הרופאים, ולדאוג לתנאים ולמשאבים המתאימים, אשר יאפשרו לרופאים לעשות כן.
154. הוועידה מברכת את המועצה המדעית על הסדרת נושא השתלמויות העמיתים, וקוראת לה להמשיך ולהוביל את הנושא.
155. הוועידה קוראת למועצה המדעית ולוועד המרכזי להקים צוות משותף, אשר יבחן את סוגיית תכנון כוח האדם ברפואה, בכל הקשור למספר הרופאים, המתמחים והמומחים במקצועות השונים, בקהילה ובבתי החולים.
156. הוועידה ממליצה - לאור חשיבות הקשר בין רפואת הקהילה לרפואת בתי החולים לרצף הטיפול הרפואי, ולאור הגידול בהיקף הפעילות הרפואית המתבצעת בקהילה - לקבוע כי במקצועות רפואה שבהם חלק ניכר מהפעילות מתקיים בקהילה, תהיה רוטציה מתוקצבת בקהילה, במהלך ההתמחות, תוך מתן פתרון לבעיית התקינה.
157. הוועידה קוראת למועצה המדעית להכין תוכניות השתלמות מיוחדות לרופאים הכלליים, כך שרופא שיעמוד בהן בהצלחה, יקבל מעמד, הכרה ותגמול בתחום עבודתו.
158. הוועידה קוראת למועצה המדעית להמשיך ולפעול עם האיגודים המדעיים לרענון ולעדכון מתמיד של מסלולי ההתמחות והסילבוסים ברוח התקדמות הרפואה.
159. הוועידה מברכת על פעילותה של המועצה המדעית בפיתוח השירות לרופאים המתמחים באמצעות הקמת יחידת השירות למתמחה, פיתוח אתר המתמחים באינטרנט, החלת נוהל מזורז לאישור בקשות לתואר מומחה ועוד, וקוראת לה להמשיך ולהשקיע מאמצים בתחום זה.
160. הוועידה מכירה בחשיבות פעילותה של המועצה המדעית להעלאת איכותן של בחינות ההתמחות, וקוראת לה להמשיך ולקדם את התחום באמצעות שימוש באמצעים חדשניים.