Центральный комитет – высший административный орган медицинской ассоциации, являющийся ее полномочным представителем в вопросах внутренней и внешней политики. Председатель руководит работой центрального комитета и секретариата, созывает их заседания и выступает в качестве полномочного представителя центрального комитета в учреждениях здравоохранения и иных учреждениях в Израиле и за границей. Задачей центрального комитета является определение политики ИМА, контроль за деятельностью секретариата и ратификация принятых решений.
Центральный комитет осуществляет надзор за учреждениями ИМА, подписывает коллективные договора и соглашения и всемерно способствует реализации целей ИМА в соответствии с ее уставом.