בחודש נובמבר 2012 נחתם 
הסכם קיבוצי מיוחד המעדכן את ההסדר הפנסיוני של הרופאים ומגדיל את בסיס השכר לפנסיה על חשבון קופת גמל.
בעקבות ההסכם, בגין חלק של 80% מההשתכרות (שכר קבוע+תורנות/כוננות אך ללא החזר הוצאות) תועברנה הפרשות להסדר פנסיוני, ורק בגין היתרה - 20%, תועברנה הפרשות לקופת גמל.
ההסכם חל גם על רופאים מוחרגים (רופאי שירותי בריאות כללית שהוגדרו כמוחרגים בהסכם 2000) וכן על רופאי מינהל במשרד הבריאות ובלשכות הבריאות שבמשרד הבריאות להם היתה השלמה ל-85% לקרן פנסיה צוברת, ובהתאם להסכם החדש תבוצע השלמת הפרשה לקרן פנסיה עד ל-95% מהשכר עד רמת עבודה נוספת (כולל).
לשאלות בנושא ההסכם הפנסיוני ניתן לפנות 
למחלקה המשפטית או בטלפון 03-6100523