הר"י חברה בארגונים בינלאומיים ומקיימת קשרי גומלין הדוקים עם ההסתדרויות הרפואיות השונות בעולם. בנוסף לכך, הר"י מקדמת קשר בין מדינת ישראל לבין רופאים בתפוצות, בין היתר, על ידי צירופם כחברי חוץ להר"י, על מנת להעמיק את שיתוף הפעולה וההפריה המקצועית.