רופאות ורופאים שהתקבלו להתמחות במסגרת מוכרת בישראל, יכולים לבחור לבצע אותה במסלול אישי מותאם להם לפי הסילבוס הישראלי במקצוע. התכנית תיבנה על ידי מנהל/ת המחלקה עבור כל רופא/ה בנפרד.
תכנית ההתמחות האישית תוגש לאישור המועצה המדעית, כחלק מהמסמכים הדרושים לפתיחת פנקס ההתמחות, תוך 60 יום ממועד תחילת ההתמחות. פורמט התכנית ייראה כך:
תאריך התחלה
תאריך סיום
מחלקה
מספר חודשים
הערות